Ο Φ.Δ. Λιμνοθάλασσας Μεσολογγίου είναι Ν.Π.Ι.Δ. και σκοπός του είναι η ανάδειξη της περιοχής του Εθνικού Πάρκου Λιμνοθάλασσας Μεσολογγίου – Αιτωλικού, κάτω ρου και εκβολών ποταμού Αχελώου και Ευήνου και νήσων Εχινάδων, στα πλαίσια μιας πολιτικής αειφόρου ανάπτυξης.
Η επιλογή των Νίκου ΑΝΑΓΝΟΠΟΥΛΟΥ από το Υ.Π.Ε.Κ.Α. (αποφ. 30553/ΦΕΚ538Β’/29.12.2009) αποτελεί έμπρακτη αναγνώριση της πολύχρονης παρουσίας του στα δρώμενα της αλιείας, της υδατοκαλλιέργειας και της αειφόρου ανάπτυξης της υπαίθρου.